De primære forskningsområder i miljømedicin afdelingen omfatter prospektive fødselskohorter (herunder Odense Børnekohorte) og påvirkningen af tidlig eksponering for miljøkemikalier samt deres skadelige virkninger på organfunktioner (f.eks. hjernen, immunsystemet, stofskiftet og reproduktionssystemet). Andre områder inkluderer hormonforstyrrende stoffer, human biomonitorering, analytisk kemi, toksikologi og risikovurdering.
Afdelingen har en lang tradition inden for miljøkemikalier og biomarkører samt udvikling af analytiske kemiske metoder til måling af disse. I øjeblikket er Per- og Polyfluorerede Alkylstoffer (PFAS) et hovedfokusområde, både hvad angår de skadelige helbredseffekter ved eksponering, biomonitorering og rådgivning af nationale og internationale myndigheder samt højt eksponerede individer.